Eksplorasi tumbuhan  akuatik adalah suatu aktivitas untuk menganalisis potensi, jasa dan manfaat serta pengelolaan potensi sumberdaya tumbuhan akuatik. Pada dasarnay tumbuhan akuatik akan terbagi menjadi dua bagian  besar yaitu, sumberdaya tumbuhan akuatik pesisir dan darat serta potensi sumberdaya tumbuhan akuatik laut. Potensi sumberdaya tumbuhan akuatik ini berasal dari ekosistem mangrove, ekosistem tumbuhan akuatik ari tawar, ekosistem lamun dan ekosistem rumput laut. Dalam eksplorasi tumbuhan akuatik ini akan dianalisis potensi jasa ekosistem  yang diberikan, baik jasa ekonomi, jasa tumbuhan obat atau jasa lainnya.  Selain itu akan dilakukan analisis pengelolaan potensi sumberdaya akuatik untuk mempertahankan keberadaan dan potensi jasa dan manfaat dari tumbuha n akuatik ini. Pengelolaan tumbuhan akuatik ini dibangun untuk mempertahanka keberadaan dan kelestarian dari tumbuhan akuatik